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概要

Prototypeは2つのゲームのうちの1つで、ユーザーはアレックス・マーサーを操作し、マンハッタン中に発生したBLACKLIGHTと呼ばれるウイルス感染を食い止めるために戦う。アレックス自身もウイルスに感染しており、特殊な能力を持つミュータントとなっている。

ストーリー

ゲームでは、アレクサンダー・J・マーサー（声：バリー・ペッパー）がマンハッタンに本社を置く遺伝子工学会社Gentekの地下にある死体安置所で目を覚ます。アレックスは逃げ出し、科学者たちが軍の工作員に銃殺されるのを目撃する。アレックスは発見され、襲われる。アレックスは胸に撃ち込まれた銃弾を生き延び、壁を飛び越えて無事だった。やがて彼は、強力な変身能力、超人的な強さ、スピード、敏捷性、耐久性、感覚、持久力、武器、そして人の記憶や技能、外見を得るために人を「消費」する能力を持っていることに気づく。前世の記憶がないアレックスは、真実を明らかにするため、陰謀に関係する人物を探し出し、消費することを決意する。それは、生物兵器との戦いに特化したフォートデトリックの特殊部隊であるアメリカ海兵隊とブラックウォッチ、そしてマンハッタンを蹂躙するブラックライトと呼ばれるウイルスによって生み出された怪物、感染者たちである。ブラックウォッチ隊員のロバート・クロス大尉（声：ジェフリー・ピアース）は、アレックスの発見と封じ込めを命じられる。

アレックスは妹のダナ（声：レイク・ベル）と接触し、標的の追跡を手伝ってもらう。彼はそのビルでエリザベス・グリーンという若い女性が収容されているのを発見する。グリーンはBLACKLIGHTの宿主であり、彼女が逃亡するとマンハッタンにBLACKLIGHTを放つ。ダナはアレックスに元恋人のカレン・パーカーを紹介。彼女はアレックスにウィルスのサンプルを持ち帰ることを要求する一方で、ウィルス阻止のために彼を助けることに同意する。その後、カレンはアレックスを罠に導き、クロスと対峙する。戦いの最中、アレックスはクロスを倒しかけたが、クロスが "ペン・ステーション "に言及したため、フラッシュバックが起こり、アレックスは朦朧とする。アレックスは寄生虫を注射され、命を狙われる。アレックスはゲンテックとつながりのある病理学者ラグランド博士に助けを求める。ラグランドはアレックスが寄生虫を取り除き、それをグリーンに対する武器に変えるのを助ける。しかし、彼女の体が寄生虫を即座に拒絶したため、グリーンには効果がなく、拒絶されたバイオマスは怪物的存在であるスプリーム・ハンターを形成し、アレックスはそれを殺す。

ウイルスとエリザベス・グリーンの起源は、ある接触によって明らかになる。1969年、政府はアイダホ州ホープでウイルスの前身をテストした。ウイルスは突然変異ではるかに致命的なものに変化し、全住民が感染した。エリザベス・グリーンは唯一の生存者であった。彼女の体内の生物学的異常がウイルスを受け入れ、コードネームPARIAHと呼ばれる彼女の生まれてくる息子の遺伝子コードとともに彼女の遺伝子コードを書き換えた。アイダホ州ホープの残存人口はブラックウォッチによって整理された。グリーンとパライアはさらなる研究のために監禁された。

アレックスは自らの過去を知る：ブラックウォッチは情報漏えいを理由にジェンテック・プロジェクトを停止し、プロジェクト関係者全員の抹殺を命じた。アレックス・マーサーは「保険」としてブラックライトのサンプルを持ち出した。やがてペンステーションでブラックウォッチに拘束される。アレックスは自暴自棄と復讐の最後の行動として、銃殺される前にBLACKLIGHTの入った小瓶を砕き、ウイルスを放出した。ウイルスは銃弾の穴からマーサーの血流に入り、彼の体を細胞レベルで修復した。

コンタクトとアレックスは、ウイルスを直接戦える地上に追いやるため、新しい生物剤「BLOODTOX」を地下に送り込み、そびえ立つ怪物に包まれたグリーンを出現させる。グリーンは倒されると人間の姿で怪物から落ち、アレックスに飲み込まれる。彼女の記憶を通して、ブラックウォッチのトップであるランデル将軍が核兵器でマンハッタンを破壊する準備をしていることが明らかになる。接触者はクロスと判明。アレックスは船長の協力を得て、ランドルを阻止するためにUSSロナルド・レーガンに潜入する。アレックスがランドルを食べると、クロスは自分を食べた後にクロスの正体となったスプリーム・ハンターであることが判明し、アレックスに襲いかかる。ブラックウォッチがNYZを離れたら、もう感染者を探す必要はない。アレックスはスプリーム・ハンターを倒し、ヘリで武器を大西洋に移動させる。彼の亡骸は街に戻り、カラスを食べた後に再生する。

クレジットの中で、世間は軍部が感染を食い止めたと考えていることが明らかになる。アメリカの上院議員が、マンハッタンでの出来事は核と生物兵器によるテロ事件であり、責任者に報復を約束するとメディアに語っているのが聞こえる。アレックスは、起こった出来事と自分自身について明らかになった真実を振り返り、自分は「人間以下のものになったが、それ以上のものにもなった」と主張する。クレジットの後、マンハッタンは徐々に回復し、ウイルスはほぼ完全に根絶されたことが示される。タイムズ・スクエアのロイター・ビルの屋上に立つアレックスは、自分の仕事はほぼ終わったとコメントする。